Thomas E. Bauer ze względu na świetne wyczucie różnych stylów jest dziś jednym z najbardziej poszukiwanych barytonów. Z równym powodzeniem śpiewa pieśni, oratoria i opery, doskonale czuje się w repertuarze barokowym, ale także w muzyce współczesnej. W repertuarze dawnym występował ostatnio pod batutą Bernarda Haitanka z Boston Symphony (Pasja św. Mateusza Bacha), z Combattimento Consort Amsterdam (Oratorium na Boże Narodzenie Bacha), z De Nederlandse Bachvereniging (Stworzenie Świata Haydna), z Orquesta Barroca de Sewilla (Mesjasz Haendla), odbył również kilka tras koncertowych z Philippem Herreweghe. Jego ważniejsze realizacje z muzyki nowej to ostatnio wykonania Quaderno di strada Salvatora Sciarrino (Salzburg), Sechs Nietzsche Gesänge Ružicki (Monachium), VIII Symfonia – Pieśni o Przemijaniu Pendereckiego dla Radia France z transmisją do 26 krajów, dzieła Luigiego Nono, Wilhelma Killmayera i Wolfganga Rihma.
W sezonie 2008/2009 śpiewać będzie główne partie w operach Petera Ružicki (Celan), Petera Maxwella Daviesa, Monteverdiego, Rossiniego, Berga, Debussy'iego, Busoniego, Henzego, Rihma i Mozarta.
Nagrał wszystkie pieśni Roberta Schumanna z towarzyszeniem pianistki Uty Hielscher, występuje również z mistrzem pianoforte Josem van Immerseelem, z którym wykonał pieśni Schuberta w Cité de la Musique w Paryżu.