Ernst Kovacic został zaliczony do grona najlepszych skrzypków swojego pokolenia dzięki wybitnym interpretacjom utworów Bacha, Mozarta i szczególnemu zainteresowaniu nową muzyką. Swoje utwory dedykowali mu m.in. Křenek, Cerha, Schwertsik, Holloway, Osborne. W tym sezonie na festiwalu Wien Modern dokonał prawykonania Koncertu skrzypcowego Clemensa Gadenstättersa. Jako solista występował z takimi dyrygentami jak Franz Welser-Möst, Roger Norrington, Simon Rattle, Esa Pekka Salonen, Michael Gielen.
Gościł na najważniejszych festiwalach Austrii, Niemiec, Włoch, Szwajcarii i Anglii. W latach 1996-98 był dyrektorem artystycznym Wiedeńskiej Orkiestry Kameralnej. Dyrygując od pulpitu współpracował m.in. z Angielską Orkiestrą Kameralną, St. Paul´s Chamber, Klangforum Wien, Ensemble Modern, Camerata Salzburg.
W 2007 r. objął dyrekcję artystyczną Orkiestry Kameralnej Leopoldinum we Wrocławiu. Z tym zespołem wystąpił na Festiwalu Flandryjskim, Brücken-Festival oraz podczas „Warszawskiej Jesieni” w 2008 r. a ostatnio nagrał wszystkie utwory Ernsta Křeneka na instrumenty smyczkowe. Wkrótce ukaże się ich premierowe nagranie młodzieńczych utworów Beethovena na skrzypce i orkiestrę.
Ernst Kovacic gra na skrzypcach Giovanniego Battisty Guadagniniego z 1753 r.