Lydia Caruana urodziła się na Malcie; muzyki uczyła się początkowo w Valletcie; studiowała śpiew u Antoinette Miggiani oraz w klasie mistrzowskiej Sony Ghazarian w Wiedniu. Debiutowała w Teatru Manoel w Valletcie, w Cyganerii; następnie śpiewała główne partie w operach Donizettiego, Pucciniego, Mozarta, Johanna Straussa; występowała również w rzadko wystawianych operach jak np. w Jeannot i Colin maltańskiego kompozytora Nicolo Isouarda czy I Martiri innego Maltańczyka – Carmelo Pace.
Lydia Caruana dużo koncertuje i posiada imponująco rozległy repertuar. Gościła w ważniejszych salach koncertowych Europy, m. in. w Wiedniu, Dublinie, Hamburgu, Pradze, Bolonii i całych Niemczech. W roku 2006 zaprezentowała program mozartowski podczas festiwalu w Valletcie oraz w katedrze św. Idziego w Edynburgu. Występowała przy różnych okazjach z Josè Carrerasem oraz Andrea Bocellim. Partnerem jej recitali jest pianista Paul Gulda, z którym nagrała pieśni basenu Morza Śródziemnego.
W marcu 2009 r. zadebiutowała w wiedeńskiej Musikverein jako Sara w oratorium Haydna Il ritorno di Tobia z towarzyszeniem Wiener Akademie pod batutą Martina Haselböcka.