Jako piętnastolatek był skrzypkiem orkiestry All Antico w Liceum Muzycznym w Krakowie i wraz z nią zdobył I miejsce w Konkursie Orkiestr Kameralnych im. Herberta von Karajana w Berlinie (1974). Wtedy miał okazję grać pod batutą Mistrza. W 1976 roku, jako uczeń Antoniego Cofalika, zdobył IV nagrodę na Ogólnopolskim Konkursie Skrzypcowym im. Z. Jahnkego w Poznaniu, rok później był półfinalistą Międzynarodowego Konkursu Skrzypcowego im. Wieniawskiego w Poznaniu. Studia skrzypcowe kontynuował u prof. Kaji Danczowskiej, grając też w Polskiej Orkiestrze Kameralnej.

Studia dyrygenckie ukończył z wyróżnieniem w 1984 roku w Akademii Muzycznej w Krakowie, w klasie prof. Krzysztofa Missony. Debiut dyrygencki miał w 1981 roku z Orkiestrą Akademii Muzycznej w Krakowie. W latach 1982-84 był asystentem dyrygenta i koncertmistrzem Orkiestry Filharmonii Krakowskiej, 1984-86 dyrektorem artystycznym Filharmonii Bałtyckiej w Gdańsku, a następnie (1986–90) dyrygentem Warszawskiej Orkiestry Kameralnej. W sezonie 1990/91 pracował jako drugi dyrygent w Filharmonii im. A. Rubinstaina w Łodzi, zaś w latach 1991-94 był wicedyrektorem i dyrygentem Polskiej Orkiestry Radiowej w Warszawie.

Dokonał wielu nagrań archiwalnych dla Polskiego Radia, nagrywa dla firm: Europa Musica, Polmusic, Denon, Polskie Nagrania, Pro Musica Camerata.
Wojciech Czepiel jest dyrektorem artystycznym i dyrygentem Narodowej Orkiestry Symfonicznej w Bejrucie oraz dyrygentem Orkiestry Symfonicznej Akademii Muzycznej w Krakowie.