Chór Kaunas został założony w 1969 roku jako zespół Litewskiego Towarzystwa Filharmonicznego. Chór rozwijał swoją działalność stopniowo, zaczynając od wykonywania drobnych utworów i pieśni oraz utworów kompozytorów litewskich. W 1971 roku wykonał Requiem Mozarta. Od tego momentu zaczął opracowywać wielki repertuar. Dziś ma wyrobioną własną markę. Chór od samego początku prowadzi jeden z najznamienitszych obecnie muzyków litewskich, Petras Bingelis wraz z asystentem Algimantasem Mišeikisem, również związanym z chórem niemal od samego początku.
Repertuar chóru obejmuje obecnie 70 utworów, takich jak Msza h-moll Bacha, Missa Solemnis i IX Symfonia Beethovena, oratoria Haendla, II i VIII Symfonia Mahlera, trylogia Orffa Carmina Burana, Catulli Carmina i The Triumph of Aphrodite, Requiem i opera Forza del Destino Verdiego oraz utwory Stravinskiego, Vivaldiego, Rossiniego, Dvořáka, Schuberta, Gershwina i innych.
Chór wykonuje także utwory kompozytorów litewskich, na przykład oratoria Broniusa Kutavičiusa i Juliusa Juzeliunasa, Requiem Vidmantasa Bartulisa i pieśni klasyków litewskich: Juozasa Naujalisa, Stasysa Šimkusa, Balysa Dvarionasa, Vladasa Jakubenasa, Jeronimasa Kačinskasa i innych. Doskonale znany w byłym Związku Radzieckim, chór dał się poznać także Zachodowi, wykonując w Paryżu i Berlinie Symfonię Wiosenną Mikisa Theodorakisa.
Po odzyskaniu przez Litwę niepodległości i zdjęciu żelaznej kurtyny chór rozpoczął wzmożoną aktywność, współpracując między innymi z legendarnym skrzypkiem i dyrygentem Yehudi Menuhinem. W 1992 roku chór brał udział w znanym festiwalu „Nowe i Stare Drogi do Indii”, poświęconym 500. rocznicy odkrycia Ameryki.
Wiele gazet europejskich nazwało chór największym odkryciem muzycznym roku. Opinię tę dzielił także Yehudi Menuhin. Jednym z najbardziej znaczących występów chóru był koncert z Litewską Narodową Orkiestrą Symfoniczną pod batutą niemieckiego dyrygenta Justusa Frantza w Berlin Stadium, dla 75 tysięcznej publiczności.
Z Yehudi Menuhinem za pulpitem dyrygenckim, chór odbył tournee po Francji, Włoszech, Hiszpanii, Niemczech, Egipcie i Rosji, wykonując teatralne przedstawienia Mesjasza Haendla. Wersję koncertową tego utworu zespół śpiewał w Argentynie i Chile.
Wykonanie Mszy h-moll Bacha wraz z Litewską Orkiestrą Kameralną pod batutą prof. Sauliusa Sondeckisa zapoczątkowało długą współpracę chóru z tym wielkim dyrygentem. W najznamienitszych salach koncertowych Litwy i innych krajów wspólnie wykonywali Mesjasza Handela oraz utwory Vivaldiego, Mozarta i Schuberta.
Szczególnie owocna była także długotrwała współpraca chóru z Litewską Narodową Orkiestrą Symfoniczną i jej liderem Juozasem Domarkasem. Razem wykonali wiele arcydzieł muzyki klasycznej na Litwie, a także w Moskwie, St. Petersburgu i Europie Zachodniej.
Chór Kaunas brał udział w wielu międzynarodowych festiwalach, takich jak: Bordeaux Spring, Mediterranean Sea, festiwalach w Reims, Strasburgu, Schleswig-Holstein Festival, Festiwalu Krajów Europy Środkowej (Niemcy) w Turku (Finlandia), Bergen (Norwegia), Maspalomas (Wyspy Kanaryjskie). Współpracował z orkiestrami z Paryża, Bordeaux, Polski, Moskwy, St. Petersburga, z Teatru Collon (Argentyna) i innymi. Występował pod batutą tak znanych dyrygentów, jak: Lord Yehudi Menuhin, Krzysztof Penderecki, Justus Franz, Ivo Raichev, Dmitri Kitajenko, Vladimir Fedosejev, Jurij Bashmet, Juozas Domarkas, Saulius Sondeckis, Jonas Aleksa i Gintaras Rinkevičius.
W ostatnim czasie chór współpracował z wybitnym wiolonczelistą Mścisławem Rostropowiczem. Wykonanie IX Symfonii Beethovena na Festiwalu Evian (Francja) roztoczyło przed chórem nowe perspektywy. Tak wielkie sławy, jak Yehudi Menuhin, Justus Frantz i Mścisław Rostropowicz chwaliły chór za kulturę śpiewu, perfekcyjną intonację i szeroką skalę i siłę głosu.
